O Santos conquistou seu primeiro título nacional em 1961 vencendo o Bahia na final da Taça Brasil tendo como artilheiro Pelé com 9 gols. Essa competição era o campeonato brasileiro da CBD (Confederação Brasileira de Desportos), que qualificou a equipe para jogar a Taça Libertadores da América em 1962.

Equipes que participaram da edição da Taça Brasil de 1961
Veja mais detalhes dessa edição:
A Taça Brasil de 1961 foi dividida em quatro fases.
1º Fase: Os clubes foram divididos nos seguintes grupos: Norte, Nordeste, Leste e Sul.
2º Fase: Os vencedores dos grupos Norte e Nordeste jogavam entre si por uma vaga, e os clubes dos grupos Leste e Sul decidiram outra vaga.
3° Fase: Na fase seguinte os clubes que se classificaram enfrentavam Santos (campeão paulista 1960) e América-RJ (campeão carioca 1960) nas semifinais.
4° Fase:Os vencedores das semifinais jogavam a final.
Campanha do Santos:
5 jogos
3 vitórias
1 empate
1 derrota
Gols Pró: 18
Gols Contra: 6
Saldo de Gols: +12
Jogos decisivos:
Semifinais
11/11/1961 – Estádio São Januário/RJ: América-RJ 2 x 6 Santos
19/11/1961 – Estádio Vila Belmiro/SP: Santos 0 x 1 América-RJ
27/11/1961 – Estádio Pacaembu/SP: Santos 6 x 1 América-RJ
23/11/1961 – Estádio Aflitos/PE: Náutico-PE 0 x 0 Bahia
27/11/1961 – Estádio Fonte Nova/BA: 1 x 0 Náutico-PE
Finais
22/12/1961 – Estádio Fonte Nova/BA: Bahia 1 x 1 Santos
27/12/1961 – Estádio Pacaembu/SP: Santos 5 x 1 Bahia
Elenco campeão: Laércio (Silas), Lima, Mauro (Olavo) e Dalmo, Calvet e Zito, Dorval, Tite, Coutinho, Pelé e Pepe. Técnico: Lula