O Santos conquistou seu segundo título nacional em 1962 vencendo o Botafogo-RJ na final da Taça Brasil tendo como artilheiro Coutinho com 7 gols. Essa competição era o campeonato brasileiro da CBD (Confederação Brasileira de Desportos), que qualificou a equipe carioca para jogar a Taça Libertadores da América em 1963 pois o Santos já tinha uma vaga garantida por ser o atual campeão do sulamericano.

Equipes que participaram da edição da Taça Brasil de 1962
Veja mais detalhes dessa edição:
A Taça Brasil de 1962 foi dividida em quatro fases.
1º Fase: Os clubes foram divididos nos seguintes grupos: Norte, Nordeste, Leste e Sul.
2º Fase: Os vencedores dos grupos Norte e Nordeste jogavam entre si por uma vaga, e os clubes dos grupos Leste e Sul decidiram outra vaga.
3° Fase: Na fase seguinte os clubes que se classificaram enfrentavam Santos (campeão paulista 1961) e Botafogo (campeão carioca 1961) nas semifinais.
4° Fase: Os vencedores das semifinais jogavam a final.
Campanha do Santos:
5 jogos
3 vitórias
1 empate
1 derrota
Gols Pró: 15
Gols Contra: 7
Saldo de Gols: +8
Jogos decisivos
Semifinais
12/01/1963 – Ilha do Retiro/PE: Sport-PE 1 x 1 Santos
16/01/1963 – Estádio Pacaembu/SP: Santos 4 x 0 Sport-PE
21/11/1962 – Estádio Maracanã/RJ: Botafogo 2 x 2 Internacional-RS
28/11/1962 – Estádio Olímpico/RS: Internacional-RS 2 x 2 Botafogo-RJ
30/11/1962 – Estádio Olímpico/RS: Internacional-RS 0 x 2 Botafogo-RJ
Finais
19/03/1963 – Estádio Pacaembu/SP: Santos 4 x 3 Botafogo-RJ
31/03/1963 – Estádio Maracanã/RJ: Botafogo-RJ 3 x 1 Santos
02/04/1963 – Estádio Maracanã/RJ: Botafogo-RJ 0 x 5 Santos
Elenco campeão: Gilmar, Lima, Mauro, Calvet, Dalmo, Zito ,Mengálvio, Dorval, Coutinho (Tite), Pelé e Pepe. Técnico: Lula.